Niveau logiciel il en existe déjà un qui s'appelle Velvet: http://www.velvet.ht.st/ et qui s'interesse plus particulèrement aux paramètres de culture.
Pour ce qui est d'une strainbase sous Php/MySQL on en parle régulièrement mais pour le moment rien n'a été fait pour cause de flemingite aigüe. Ca peut tout à fait être hebergé sur LMV faut juste s'y mettre.