Je connais pas trop ton système mais l'utilisation de 2 pompes ne me semblent pas utile !!
Pour ma part j'utilise une pompe qui passe dans mon circuit d'eau qui se compose de 2 vannes et d'un filtre.
La vanne de gauche ouverte/l'autre fermée : direct vers les plantes
La vanne de gauche fermée/l'autre ouverte : circulation interne dans le bac de nutrition...
Tu raccordes ca à un minuteur et le tour est joué....
Il n'y a pas plus simple....
Bonne continuation
